基因組測(cè)序:洞察瀕危穿山甲的免疫奧秘

2018-10-12 00:00 瀏覽量: 4045
?智能總結(jié)穿山甲(鱗片食蟻獸)是世界上最瀕危的物種之一。它沒有牙齒,幾乎沒有視覺,通常利用高度發(fā)達(dá)的嗅覺來覓食螞蟻。 由西交利物浦大學(xué)朱紹和(Siew Woh Choo)博士領(lǐng)導(dǎo)的國(guó)際研究小組對(duì)這種瀕危動(dòng)物的基...
穿山甲(鱗片食蟻獸)是世界上最瀕危的物種之一。它沒有牙齒,幾乎沒有視覺,通常利用高度發(fā)達(dá)的嗅覺來覓食螞蟻。 由西交利物浦大學(xué)朱紹和(Siew Woh Choo)博士領(lǐng)導(dǎo)的國(guó)際研究小組對(duì)這種瀕危動(dòng)物的基因組進(jìn)行了測(cè)序和研究,該研究成果將有助于人類對(duì)其他哺乳動(dòng)物(包括人類自身)的免疫力建立更深入的了解。 “我們已經(jīng)完成了全球第一個(gè)穿山甲的全基因組測(cè)序及其基因組圖譜?!蔽鹘焕锲执髮W(xué)醫(yī)療與技術(shù)研究中心主任、生物科學(xué)系朱紹和博士說,“穿山甲全基因組測(cè)序在此之前一直未能實(shí)現(xiàn),很大程度上是因?yàn)殡y以獲得穿山甲的DNA樣本?!?由于選擇性飲食習(xí)慣及免疫力低下的問題,穿山甲很難適應(yīng)人工飼養(yǎng)。此外,穿山甲非常容易受到偷獵者的“光顧”,這是因?yàn)樵谠侥虾椭袊?guó)的部分地區(qū),穿山甲被認(rèn)為是一種美味佳肴,其鱗片作為傳統(tǒng)中醫(yī)藥材,千百年來被用于治療各種疾病。 穿山甲這一物種的脆弱性和獨(dú)特性,成為吸引朱紹和博士開展研究的內(nèi)在動(dòng)因: “我希望能嘗試幫助和保護(hù)這一瀕臨滅絕的物種,”他說,“同時(shí)我相信,對(duì)穿山甲基因組進(jìn)行測(cè)序,有助于揭示與醫(yī)藥科學(xué)息息相關(guān)的有關(guān)免疫力方面的奧秘?!敝旖B和博士及其研究團(tuán)隊(duì)從兩種極度瀕危的穿山甲——中華穿山甲和馬來亞穿山甲中獲取DNA樣本,這些樣本被用于測(cè)序。其后,朱紹和博士將獲取的基因組數(shù)據(jù)與美國(guó)、俄羅斯、馬來西亞、葡萄牙以及北京大學(xué)、上海紐約大學(xué)的研究人員共享?!按┥郊椎幕蚪M相當(dāng)龐大——幾乎接近于人類基因組的規(guī)模;因此我們組建了一支國(guó)際科研團(tuán)隊(duì),共同完成數(shù)據(jù)分析的工作?!彼f。由朱紹和博士領(lǐng)導(dǎo)的這一國(guó)際團(tuán)隊(duì),嘗試通過穿山甲基因組的測(cè)序及分析,更深入地了解這一瀕危物種的遺傳特質(zhì)。他們還試圖回答一個(gè)特定問題:是否有遺傳證據(jù)支持“穿山甲鱗片的進(jìn)化是為了保護(hù)它免受微生物感染”這一假設(shè)? “穿山甲是唯一有鱗片護(hù)體的哺乳動(dòng)物?!彼榻B道,“鱗片能保護(hù)穿山甲免受掠食者的攻擊,這一點(diǎn)看起來很明顯;但是,鱗片有助于改善穿山甲的免疫反應(yīng),這一功能卻不是那么明顯?!边M(jìn)化過程中發(fā)生的突變,可能導(dǎo)致某些基因變成假基因或喪失功能。研究小組證實(shí),某些與穿山甲免疫力相關(guān)的基因就屬于這種情況,包括基因干擾素ε(IFNE)?!把芯坑幸豁?xiàng)重大發(fā)現(xiàn):IFNE基因在我們所檢測(cè)的兩種穿山甲體內(nèi)都呈現(xiàn)‘假基因化’、失去功能的狀態(tài),而這種基因在人體中能正常運(yùn)作,并對(duì)皮膚和黏膜的免疫力發(fā)揮重要作用?!敝旖B和博士解釋道,“該基因在我們的皮膚表層,以及黏膜保護(hù)的腸道和肺部中表達(dá),為試圖進(jìn)入體內(nèi)的病原體設(shè)置了第一道防線?!贝┥郊椎镊[片不僅可以幫助它抵御掠食動(dòng)物攻擊,還能保護(hù)它免受創(chuàng)傷和防止隨后的微生物感染;從進(jìn)化的角度來看,其鱗片的意義可能在一定程度上是為了抵消IFNE基因的功能缺失所導(dǎo)致的皮膚免疫功能下降?!敖?jīng)常有人會(huì)問:'為什么要研究穿山甲(食蟻獸)的基因組,而不是人類基因組?”朱紹和博士說,“通過研究穿山甲具有獨(dú)特性的的遺傳起源,我們可以更好地了解哺乳動(dòng)物的進(jìn)化,包括人類進(jìn)化?!?!--//CLG////-->此前,朱紹和博士曾致力于將生物信息學(xué)方面的專業(yè)知識(shí)運(yùn)用于國(guó)際ENCODE(DNA元素百科全書)項(xiàng)目的研究,該項(xiàng)目通過科學(xué)研究聯(lián)盟的國(guó)際合作,旨在利用不同的技術(shù)和方法識(shí)別人類基因組中的功能元件。今年9月,蘇州獨(dú)墅湖科教創(chuàng)新區(qū)授予朱紹和博士“科教創(chuàng)新區(qū)高端人才集聚工程——科教杰出人才”稱號(hào),表彰其以科研為導(dǎo)向、以學(xué)生為中心的杰出工作。目前,朱紹和博士及其團(tuán)隊(duì)正繼續(xù)致力于穿山甲的基因研究,探索以穿山甲基因組作為一種理想的比較模型,從而對(duì)人類免疫力與疾病開展更為深入的研究。(記者:習(xí)丹義 翻譯:徐敏 編輯:石露蕓 攝影:習(xí)丹義 其他圖片來源:Shutterstock)
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