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3月16日，河南農(nóng)業(yè)大學(xué)康相濤教授團(tuán)隊基于前期雞泛基因組研究成果與公共數(shù)據(jù)，開發(fā)了適用于我國地方雞基因組系列液相芯片——“神農(nóng)1號”。該系列芯片的成功研發(fā)，搭建了用于地方雞種質(zhì)資源鑒定、精準(zhǔn)評價、保護(hù)與開發(fā)利用的高效技術(shù)平臺，對我國家禽種業(yè)振興與可持續(xù)發(fā)展具有重要的意義。

▲58個地方雞品種地理分布

該系列芯片采用模塊組合的設(shè)計思路：模塊I是利用66.5M泛基因組序列，設(shè)計5K標(biāo)記；模塊II是整合生長、繁殖、屠體等性狀GWAS的功能位點(diǎn)，設(shè)計5K標(biāo)記；模塊III是整合我國58個地方雞種中高頻SNP位點(diǎn)，設(shè)計30K標(biāo)記；模塊IV是整合生長、羽色等性狀的原因InDel、SV、PAV突變位點(diǎn)。集成上述模塊，創(chuàng)制了40K、5K地方雞基因組系列芯片——“神農(nóng)1號”。

▲“神農(nóng)1號”40K地方雞基因組芯片位點(diǎn)分布

▲“神農(nóng)1號”地方雞基因組液相芯片試劑盒

團(tuán)隊簡介

河南農(nóng)業(yè)大學(xué)家禽團(tuán)隊是教育部、農(nóng)業(yè)部科研創(chuàng)新團(tuán)隊?，F(xiàn)有16名骨干成員，其中教授9人、副教授3人。團(tuán)隊帶頭人康相濤教授先后榮獲全國先進(jìn)工作者、中華農(nóng)業(yè)英才獎和首屆國際種業(yè)科學(xué)家獎等。團(tuán)隊長期圍繞地方雞種質(zhì)資源保護(hù)和利用開展研究，先后主持承擔(dān)國家“863”計劃、國家自然科學(xué)基金、神農(nóng)種業(yè)實(shí)驗(yàn)室“一流課題”項(xiàng)目等國家和省部級科研項(xiàng)目；主持培育國審新品種2個，完成的《中國地方雞種質(zhì)資源優(yōu)異性狀發(fā)掘創(chuàng)新與應(yīng)用》獲國家技術(shù)發(fā)明獎二等獎、《地方雞保護(hù)利用技術(shù)體系創(chuàng)建與應(yīng)用》獲國家科學(xué)技術(shù)進(jìn)步獎二等獎，授權(quán)國家發(fā)明專利46項(xiàng)，制定國家和地方標(biāo)準(zhǔn)10項(xiàng)，發(fā)表中英文論文500余篇。

上述研究成果的取得主要依托于神農(nóng)種業(yè)實(shí)驗(yàn)室、農(nóng)業(yè)農(nóng)村部畜禽資源（家禽）評價利用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、河南省雞種質(zhì)資源創(chuàng)新與利用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、河南省家禽育種國際聯(lián)合實(shí)驗(yàn)室和河南省家禽種質(zhì)資源創(chuàng)新工程研究中心等省部級研究平臺，以及保存了29個特色資源、設(shè)施設(shè)備一流的河南農(nóng)業(yè)大學(xué)家禽種質(zhì)資源場。