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5月28日，四川農(nóng)業(yè)大學、中科院遺傳與發(fā)育研究所、河北大學等單位合作在Cell雜志發(fā)表了題為：“Pan-genome analysis based on 33 high-quality assemblies provides insights into hidden genomic variations in rice”的研究論文。河北大學杜會龍教授為論文共同第一作者。

在作物進化和馴化過程中，基因組結(jié)構(gòu)變異（SVs）和基因拷貝數(shù)變異（gCNVs）是重要的遺傳變異來源，到目前為止，還未有對SV和gCNV全面準確的鑒定報道。

研究人員選取了遺傳背景具有高度代表性的33個水稻材料，并對其中31份材料進行了長片段PacBio測序、高質(zhì)量基因組組裝及基因注釋。同時，研究人員對33個高質(zhì)量的水稻基因組進行了系統(tǒng)的基因組比較分析，鑒定到了大量先前尚未發(fā)現(xiàn)的SVs和gCNVs，探究了SV在亞洲栽培稻群體中的分布規(guī)律和形成機制，揭示了大量SVs和 gCNVs與基因表達量變化顯著相關(guān)，發(fā)現(xiàn)了多個與重要農(nóng)藝性狀相關(guān)的復雜優(yōu)異等位變異，證實了SV和gCNV對調(diào)控水稻農(nóng)藝性狀的重要作用。

黃色標記部分為河北大學杜會龍課題組參與人員

杜會龍教授

杜會龍，教授，畢業(yè)于中科院遺傳與發(fā)育研究所，河北大學高層次引進人才，以第一作者（含共同）在Cell（2020，2021，2021）、Nature Communications（2017，2019）、Molecular Plant（2017，2020）和Science China Life Sciences（2019，2020）發(fā)表多篇論文。目前課題組主要開展的研究方向是基于各類測序數(shù)據(jù)的基因組組裝軟件開發(fā)，復雜植物的高質(zhì)量基因組構(gòu)建及后續(xù)比較基因組、三維基因組調(diào)控、功能基因組分析、群體分析、基于圖形基因組的泛基因組分析以及生物信息學個性化分析流程搭建等研究工作。